基础医学中的生物化学、生物物理学、病理学、微生物学、寄生虫学、免疫学、遗传学等，都在流行病学调查中用来进行寻找并证实病因的研究。这些基础医学的研究与流行病学的研究互相补充、互相提供线索、互相促进。流行病学要充分应用基础医学的进展，掌握现代化的快速、高效、微量的测定技术为流行病学服务，促进流行病学发展；而流行病学的发展，又可促进基础医学学科。